多糖是由糖苷链结合的糖链，需要至少超过10个的单糖组成的聚合糖高分子碳水化合物，属于分子结构复杂且庞大的糖类物质。荧光素可以标记许多种糖类物质 ，其中就有多糖，而多糖由于其分子量大，结构复杂的原因，在结构上就具有其他物质所不具备的加工特性和流变性质。多糖本身缺乏发色基团和荧光基团，而荧光素类染料可以与-NH2、-SH、-COOH、-N3等活性基团结合，用于荧光探针对多糖进行检测和分析。
一、荧光标记壳聚糖
壳聚糖分子结构中的氨基基团比甲壳素分子中的乙酰氨基基团反应活性更强，使得壳聚糖具有良好的生物学功能并能进行化学修饰反应。使用荧光素异硫氰酸酯(FITC)作为荧光标记物，在447nm的紫外分光光度计下检测被标记在壳聚糖上的FITC，通过表征壳聚糖的荧光标记效率，并分析壳聚糖溶液pH值、浓度、反应时间以及壳聚糖分子量、脱乙酰度对壳聚糖荧光标记反应的影响。
二、荧光标记海藻酸钠多糖
海洋生物多糖是从海洋、湖泊等水生生物体内通过分离、纯化等步骤得到的多糖。比如壳多糖、海藻酸钠，螺旋藻多糖等。其中，荧光标记的海藻酸钠，是从褐藻类的海带或马尾藻中提取出的副产物，是一种天然多糖碳水化合物，由于它本身良好的特性，使得其具有药物制剂辅料所需的稳定性、溶解性、粘性和安全性。海藻酸钠目前已经逐渐作为化学改性材料和药物载体材料被广泛研究。
三、荧光标记小刺猴头菌多糖
菌类多糖主要存在于真菌植物中，如香菇、蘑菇等。小刺猴头菌多糖可以利用还原性的末端与氨基发生偶联反应。通过紫外分光光度计、酶标仪和荧光分光光度计对标记后的真菌多糖进行扫描分析，再通过计算可得出小刺猴头菌多糖的荧光物质的取代度为0.79。此外，通过对标记后的多糖体外稳定性的研究表明，小刺猴头菌发酵浸膏多糖标记物在PBS溶液、血浆及尿液中稳定性良好。
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